根据2016年6月学校官网显示，该校有14个教学单位，开办18个本科专业。
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| 二级学院 |
| 教学单位 |
专业设置
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| 基础医学院 |
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| 药学院 |
制药工程、药学、药物制剂、中药学、中药制药、中草药栽培与鉴定、生物制药 |
| 骨伤学院 |
中医学、中医学（免费医学定向生）、中西医临床医学 |
| 针灸推拿学院 |
针灸推拿学 |
| 护理学院 |
护理学、康复治疗学、运动康复 |
| 人文学院 |
法学、应用心理学、劳动与社会保障、公共事业管理、医学信息工程 |
| 研究生部 |
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| 继续教育学院 |
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| 附属医院 |
| 第一临床医学院（贵州省中医医院） |
第二临床医学院（贵阳中医二附院） |
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| 教学部 |
| 社会科学部 |
大学外语教学部 |
体育教学部 |
