军工六校是指在炮火中诞生的中国人民解放军军事工程学院(哈军工)，分裂后形成的六所军工院校，分别是:中国人民解放军国防科技大学、哈尔滨工程大学、南京理工大学、中国人民解放军陆军工程大学、中国人民解放军陆军装甲兵学院、中国人民解放军陆军防化学院。
哈军工于1952年开始筹建，1953年4月25日基建破土动工，9月1日举行第一期开学典礼，1955年初具规模，设有五个系和一个预科:一系空军工程系、二系炮兵工程系、三系海军工程系，四系装甲兵工程系、五系工兵工程系和预科(1960年又增设防化系)。1959年中央军委决定将学院培养目标改为研究、设计、制造方面的军事工程师，实施尖端专业集中，常规专业分散的方针。
1959年军委决定改变军工培养目标，由维护、使用改为研究设计。学院从1960年开始分建与扩建:将炮兵、装甲兵、工兵的常规专业和刚刚新建的防化兵工程系调出，交给有关兵种，扩建为单独的兵种工程技术学院，形成今天的南京理工大学、陆军工程大学、陆军装甲兵学院和陆军防化学院;将空军工程系中的机场建筑、航空气象2专业和海军工程系中的舰炮、舰炮指挥仪、鱼雷、水雷、舰船消磁5专业与空军、海军已经建立起来的技术学校合并，使之成为比较完整的高一级的军种工程技术院校(形成后来的空军工程大学、海军工程大学的一部分);保留空军、海军工程系中的尖端专业和1959年2月新建的导弹工程系;将附属于海军工程系的核动力装置科扩大为原子工程系;将空军、海军、炮兵3个工程系中的雷达、无线电专业集中，扩建为电子工程系。
1966年哈军工被迫转业改制，改名为哈尔滨工程学院，院系进行调整，改建和新建火箭工程系、计算机系。
1970年，学校再次分建，导弹工程系(1966年改建为火箭工程系)、电子工程系、1966年新建的电子计算机系以及基础课部和院机关内迁长沙，改名长沙工学院，归广州军区领导。1973年，国务院、中央军委决定，撤销重庆工业大学，原军工二系(原子工程系)调归长沙工学院建制。 1978年，国务院、中央军委批发《关于成立中国人民解放军国防科学技术大学的通知》〔国发(1978)110号文件〕，将长沙工学院改建为中国人民解放军国防科学技术大学，重回军队序列。
海军工程系划归第六机械工业部，拟迁武汉，后留原址组建了哈尔滨船舶工程学院，原子工程系划归第二机械工业部，迁往重庆与哈尔滨工业大学有关专业合并组建重庆工业大学，办学一段时间后，由于种种原因最终没办成，双方教师均回到哈尔滨各自学校，自此，原子系与海军系及导弹系战术导弹分部组建哈尔滨船舶工程学院，1994年更为哈尔滨工程大学，并形成了学校"三海一核"(即船舶工业、海军装备、海洋开发、核能应用)的办学特色。
空军工程系划归第三机械工业部，迁往西安，并入西北工业大学;
风洞实验室改为第三机械工业部(航空工业部)的一个研究所，现为哈尔滨空气动力研究所。
