南京医科大学坚持“以本为本”，紧盯“健康中国”国家战略发展新需求，优化专业结构，强化育人导向，完善保障体系，不断提升专业建设水平和人才培养质量。
优化专业结构。学校主动对接社会发展需求，成立全省首家儿科学院，聚拢全校儿科教学、科研、临床优质资源，拓展儿科临床专业内涵，加快儿科学专门人才培育步伐。学校在临床医学专业中新增《全科医学》课程，教授学生掌握全科医学的基本概念和诊疗服务模式，为毕业生从事社区卫生服务奠定基础。同时，学校立足拔尖医学人才培养，成立“天元班”，首次招收临床医学本硕博一贯制连读学生，通过实行“科研临床双导师制”，夯实医学理论基础，强化临床技能训练，培养高素质拔尖创新临床医学人才。
强化育人导向。建立院校一体医教协同育人机制，通过开展附属医院、临床医学院和教学医院认证工作，建立了省内临床基地认证指标体系与标准，确保临床教学规范化、标准化、同质化。优化临床教学业绩考评体系，实行副教授、教授教学特别推荐程序，激励临床教师投身教学。不断深化临床教学资源整合力度，校院一体共建医学模拟教育中心，目前，该中心已获批为国家医师资格考试实践技能考试基地、江苏省基层卫生人员实训指导中心，专业建设社会辐射能力明显提升。
完善保障体系。学校持续加强质量保障制度建设，建立“行政监控、专家监控、外部监控”三级质量监控体系。通过“教学检查、学生评教、教学督导、领导听课、学生信息员”等多种渠道，不断优化质量信息统计、分析、反馈机制。学校建立起用人单位和毕业生长期跟踪调查和反馈评价机制，以此为基础，不断调整完善招生、培养、专业质量指标体系，增强人才培养与社会需求的契合度。利用网络信息技术，打造一体化、移动教学管理质量监控信息平台，实时分析教学动态问题，促进本科教学质量的持续改进。
