传统上,清华大学为文、理并重,工程科目强势。1952年的院系调整后,文科不复存在,理科削减,工程技术相关学科实力最强,近几十年来清华大学常被比喻为中国的麻省理工学院。1980年代后期以来,开始致力于建设多学科的综合大学。在保持工程领域的优势的形势下,其生物、数、理、商、法、新闻等专业已经逐步取得领先地位
至2005年4月,清华大学有理学院、建筑学院、土木水利学院、机械工程学院、信息科学技术学院、人文社会科学学院、经济管理学院、法学院、美术学院、公共管理学院、应用技术学院、北京协和医学院、新闻与传播学院、航天航空学院等13个学院和54个系,41个研究院(所),35个研究中心和171个实验室,其中包括1个国家实验室(筹建中)、12个中国国家重点实验室和15个中国教育部重点实验室。
清华大学现有教职工7800余人,其中诺贝尔奖获得者1名(杨振宁)、图灵奖获得者1名(姚期智)、中国科学院院士35名、中国工程院院士31名,正高级专业技术职务1300余人。国家重点学科49个;本科专业60个,第二学士学位专业1个,硕士学位授权点170个,博士学位授权点128个,博士后科研流动站27个。在校全日制学生32000余名,其中本科生13000余名,硕士生13000余名,博士生近5000名。有来自46个国家和地区的在校留学生及进修生1700余名,远程教育学员9000余名。