经过87年的建设与发展，学校已由初创时的单一学科，发展成为以医学为主，医、理、管、法、文多学科相互渗透、协调发展的医科大学，形成了以本科教育为主的多层次人才培养体系。无论是办学规模、办学质量、办学效益，还是师资队伍、教学科研能力、管理水平在全国同类院校中均具有一定优势。
学校校本部现有第一临床医学院、第二临床医学院、基础医学院、公共卫生学院、法医学院、药学院、人文社会科学学院、护理学院、继续教育学院、职业技术学院10个二级学院，口腔医学系、儿科医学系、麻醉学系、医学影像学系、体育教学部、外语教学部、研究生部7个系部。我校现有4所附属医院和各类教学基地74所，其中有9所非直属附属医院，13所实习医院，各级疾病预防控制中心14所，其它实习基地38所。
附属第一、第二医院是山西省规模最大的三级甲等医院，全国百姓放心医院。两所医院开放床位1979张，医疗技术力量雄厚，有12个学科被省卫生厅及省教育厅确定为省级重点学科。附属第一医院是全省卫生系统医德医风建设先进单位，卫生部先进援外单位。附属第二医院是全国百佳医院、全国创建文明行业工作先进单位，全国卫生文化建设先进单位。
学校现设有临床医学（五年制、七年制）、预防医学、法医学、口腔医学、医学影像学、麻醉学、护理学、药学、中药学、药物制剂、社会工作、信息管理与信息系统（医药方向）、公共事业管理（卫生事业管理方向）、英语（医学方向）14个本科专业。其中，七年制临床医学专业是山西省唯一的长学制专业。
学校是全国首批硕士学位、学士学位授权单位，山西省首批博士学位授权单位，全国临床医学专业硕士学位、公共卫生专业硕士学位试点单位。共有生理学、法医学、内科学、外科学、耳鼻咽喉科学、流行病与卫生统计学、劳动卫生与环境卫生学7个博士学位授权二级学科，生物学、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、药学5个硕士学位授权一级学科，有53个硕士学位授权二级学科。生理学是国家重点学科，内科学、外科学、生物化学与分子生物学、流行病与卫生统计学、劳动卫生与环境卫生学、法医学、耳鼻咽喉科学、儿少卫生与妇幼保健学、影像医学与核医学、药理学10个省级重点学科。
学校在“十五”期间，承担国家自然科学基金项目19项，获资助经费326万元；承担省部级及以上科研项目706项，总经费4907.56万元；发表科研论文5726篇，其中，《Nature》杂志发表1篇、国家级期刊2958篇，被SCI、ISTP收录227篇；出版教材及专著528部；获各种科技奖励245项，其中，省科技进步奖145项（一等奖13项）、省高校科技进步奖36项（一等奖18项）。目前，在研项目776项，其中，国家级项目29项，省部级项目504项，其他项目243项。学校主办有《山西医科大学学报》、《中西医结合心脑血管病》、《护理研究》、《实用急救医学》等多种学术刊物。
学校现有专任教师744人，博士生导师43人，硕士生导师533人，享受国务院特殊津贴专家86人，国家级有突出贡献专家2人，教育部新世纪优秀人才1人，省级优秀专家20人，省级教学名师6人。
学校生源来自全国20多个省、市、自治区。截至2006年8月，共有普通高等教育全日制在校生8738人，其中，博士生105人，硕士生1550人，本科生6169人、专科生914人；成人高等教育学生5823人，其中，本科生2956人、专科生2867人。建校以来，学校培养了以全国首枚“白求恩奖章”获得者、“人民的好医生”赵雪芳为代表的医药卫生专业人才近4万名。近年来，学校积极调整人才培养层次结构，不断深化教学改革，人才培养质量逐步提高，毕业生就业率保持在80％以上。
学校占地总面积1864亩（含新校区占地面积），建筑总面积30.7万平方米；教学科研仪器设备总值7481.73万元；学校藏书140余万册，与国内900多个单位建立了内部图书资料交换关系。
学校与美国、日本、德国、意大利、澳大利亚、香港、台湾等国家和地区多所院校建立了教育、科技、医疗合作关系。许多教师应邀到国外参加国际学术会议、讲学或进行合作研究。同时，学校也邀请大批国外专家和学者来校讲学访问，有106名国外专家和学者被聘为山西医科大学名誉教授或客座教授。
