特色专业：
【经管法实验班】该班成立于 2001 年，是教育部为了适应经济全球化和加入 WTO 后国家对复合型高级经济管理人才的需求，选取我校为试点成立的“经济、管理、法学复合型人才培养实验班”， 每年从我校经济学院、法学院和商学院工商管理类专业的入学新生中按照“自愿报名，择优录取”的原则遴选。该班的培养目标是适应 21 世纪经济社会发展所需要的，具有扎实的经济学、管理学和法学基础知识和较强应用能力，主要从事经济管理、企业管理、法律以及教学科研工作的国际化、高层次、复合型人才。2007年该实验班被教育部批准为国家创新人才培养实验区。目前已经有四届毕业生，50%以上的学生被免试推荐为研究生，部分就业的毕业生也受到用人单位的好评，体现出了复合型知识结构的巨大优势。
【数学试点班】经教育部批准，由著名数学大师、南开数学所名誉所长陈省身教授亲自创办的。该班除主要招收在中国数学奥林匹克竞赛中获奖的保送生外，还会在考入我校数学类专业的学生中选拔部分学生进入该班学习。数学试点班的毕业生70 ％被免试推荐及考取研究生或出国留学继续深造，成为国内外数学各个方向以及经济学、信息与计算机、理论物理、统计、软件、管理、保险、经济类等许多方向的硕士研究生或直接攻读博士学位研究生。本科阶段打好数学基础，研究生阶段分流培养，是数学试点班的总思路。
【信息安全－法学双学位试点班】该试点班主要培养具有扎实的数理基础和信息安全学科知识、较深厚的信息安全管理与信息安全法律底蕴，能够从事信息安全技术产品研究与开发、信息安全法律法规制定、计算机网络与大型信息系统安全设计、工程开发与系统管理，信息安全理论与法律法规研究与应用的高级专门人才。学生修满教学计划所规定的学分，符合毕业条件，授予工学和法学双学位。
【会计学（国际会计方向）】由南开大学与加拿大注册会计师协会合作开办，培养有系统理论基础知识、有实际操作技能、有专业道德和敬业精神、通晓国际会计惯例的高级会计人才为目标，以合作办学为契机，实施循序渐进、全过程专业课双语教学模式。国际会计专业方向的毕业生的就业形势非常乐观，除了继续攻读研究生和出国深造的毕业生之外，其他同学的就业领域主要是大型跨国公司，大型会计师事务所、上市公司、政府机关、银行等。
合办专业：
遵循“独立办学，紧密合作”的办学方式，南开大学和天津大学合办了两个专业，一是分子科学与工程，二是光电子技术科学。
分子科学与工程的基本办学思路是：结合南开大学化学学科和天津大学化工学科的优势，优化化学与化工教学内容，增添新的交叉学科知识培养高层次人才。南开大学化学学院和天津大学化工学院各招生30名，两个学院精心制定人才培养方案和教学计划，选派优秀的主讲教师授课提供最好的实践教学条件。学生毕业后具有广泛的适应性，可到相关行业或部门从事科研、教学、开发、设计、管理等工作。同时，本专业学生将以较高比例进入研究生阶段深造，主要从事科学研究与新技术开发工作。
光电子技术科学专业创办于2003年，以两校“光学工程”国家重点学科、教育部“光电信息技术科学”重点实验室为学科依托，培养在光电子技术科学领域具有宽厚的理论基础、扎实的专业知识和熟练的实验技能的人才，使学生具有在光学、光电子学、激光科学、光通信技术、光波导与光电集成技术、光信息处理技术、计算机应用技术等领域开展创新性基础理论研究以及从事设计、开发应用和管理等工作应具备的理论和技术基础。该专业毕业生的主要去向是信息产业部门、中科院及有关研究所、电信部门、高等院校、企事业单位等。
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