能源系成立于2016年6月。该系下设三个专业，油气储运技术、石油化工生产技术、清洁生产与减排技术，其中油气储运技术、石油化工生产技术是福建省政府支持，人才紧缺的专业。现有在校学生260余名（15级83人，16级182人），专职教师12人。教师中正教授4人、工程师1人，具有硕士研究生学历的教师6人。
从成立以来，能源系在科学研究、教学改革、校企合作、实验室建设等方面取得了重大进展。在臧树良校长的带领下成立了【福建省院士专家工作站】。成立了一个省级中心【福建省清洁能源应用技术协同创新中心】和一个市级创新平台【绿色油品生产技术与应用科技创新平台】。能源系现有1300平方米校内实验实训基地，投入建设资金220万元，不仅可以承担在校学生实验和实训任务，而且可以服务社会，承揽企事业单位在岗工人培训业务。
能源系以“产业伙伴型大学创业者的摇篮”为办学宗旨，全面实行“厂校一体、产教结合”人才培养模式。已经与中石油、中石化、中海油、中化等大中型国有企业以及新奥福建燃气、安然福建燃气、振戎石化等股份制企业和公司建立校企合作伙伴关系，努力为国家和地方经济发展培养懂技术会操作的创新创业型人才。
