学校现已形成医学、理学、工学、管理学4个学科门类协调发展的教育格局。有临床医学、麻醉学、口腔医学、护理学、医学检验技术、医学影像学、医学影像技术、精神医学、预防医学、食品卫生与营养学、药学、药物分析、生物科学、生物技术、信息管理与信息系统、医学信息工程、制药工程、食品质量与安全、物联网工程、康复治疗学、应用统计学、应用心理学、卫生检验与检疫等23个本科专业，有基础医学、临床医学和护理学3个一级学科硕士学位授权点和临床医学、口腔医学和公共卫生3个硕士专业学位授权点，29个二级学科授权点。其中临床医学学科进入ESI全球排名前1%。学校拥有1个国家级特色专业，1个国家新药Ⅰ期临床研究基地，7个省级特色专业，5个省级综合改革试点专业，9个省级重点学科、特色专科，3个省级重点实验室，1个省级工程技术中心，1个省人文社科重点研究基地，1个安徽省生化药物产业技术创新战略联盟，2个省级实验教学示范中心，2个省级人才培养模式创新实验区。学校是国家级大学生创新创业实践基地和校外实践基地，教育部临床医学“5+3”改革试点高校、医学检验技术专业综合改革试点高校和临床技能综合培训中心。
