1956 年广州中医学院建校伊始就成立了体育教研室。在学校领导的关怀下，体育工作陪伴着学校发展在磨练中不断成长。 2003 年体育教研室由基础医学院下的一个教研室发展为学校的二级单位 --- 体育部。 为满足中国医药卫生事业以及体育事业发展的需要，进一步发挥广中医医体结合办学资源优势，由体育部牵头，开始申报有医体结合特色的“体育教育”新专业（保健体育与健康教育方向），并于 2005 年 3 月获批。 2006 年 11 月成立“体育健康学院”。
2007年中国大学生女子足球联赛总决赛甲组的冠军
体育健康学院下设党政办公室、学生工作办公室、体育教研室、群体教研室、体育理论教研室、学生体质监测研究室、运动医学教研室七个科室。承担着全校公共体育教学、体育专业人才的培养、学生日常管理、学生体质健康标准测定、群体竞赛活动开展、高水平运动队伍培养、校园体育文化建设、体育科学研究、体育场馆的建设与维护工作。在学校建设中发挥着日益重要的作用。
从2005 年招生开始，体育健康学院就一直坚持贯彻医体结合、凸显特色、文体并重、全面发展的素质教育人才培养理念。于2011年正式获得运动医学硕士点授予权。现有潘华山教授等多名硕士生导师，承担了国家级、省级、校级研究课题三十多项、出版著作1部。
足球队训练
体育健康学院现有体育保健与教育专业四届学生共计428人。拥有体育教师35名，教辅人员 1 名，专职辅导员 2 名。其中正高职称3人，副教授 10 名，讲师 18名，助教5名。学院教师获得国家健将级运动员称号 2 人，国家一级运动员 3 人，国家级裁判 3 人，国家一级裁判 9 人。
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